インストール
if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))
install.packages("BiocManager")
BiocManager::install("qvalue")
p | p値のベクトル ※入力必須 |
fdr.level | FDRをどのレベルで調整するか。 |
pfdr | 正の誤検出率(positive false discovery rate )を推定するかどうか |
lambda | 真の帰無仮説の割合(π₀)を推定する際に考慮すべき調整パラメータの値。 |
pi0.method | “smoother”または “bootstrap” π₀を推定する際の調整パラメータを自動的に処理する方法。デフォルトは”smoother”。 |
lfdr | TRUEにすると、FDRが1以上だった場合に1を返す。デフォルトはTRUE。 |
call | 関数呼び出し |
pi0 | Null p値の割合の推定値。 |
qvalues | 推定されたq地のベクトル |
pvalues | 元のp値のベクトル |
lfdr | local FDRの値 |
significant | fdr.level を指定した場合、その値を下回っていればTRUE、そうでなければFALSEを返す。 |
pi0.lambda | 各ラムダ値におけるNull p値の割合の推定値 |
lambda | π₀の推定値を求めるために用いるラムダ値のベクトル。 |