lmerTestパッケージに含まれる機能を使ってできることは、
- p値の計算
- 分散分析表の作成
- 最小二乗平均の計算
- ランダム効果または固定効果の選別（自動削除）
など、いろいろとありますが、ここではp値の計算についてメモしておきます。
通常、lme4パッケージのlmerを用いた線形混合効果モデルでは、anova() やsummary()を使って結果の要約を出すことができますが、p値は計算されません。
しかし、lmerTestパッケージを呼び出してから、 anova() やsummary() を使うとp値も出力されるようになります。
lmerTestパッケージのダウンロードと読み込みは以下のコードで実行できます。
install.packages("lmerTest")
install.packages("lme4")
library(lmerTest)
library(lme4)参考資料
Kuznetsova, Alexandra, Per B. Brockhoff, & Rune H. B. Christensen. “lmerTest Package: Tests in Linear Mixed Effects Models.” Journal of Statistical Software [Online], 82.13 (2017): 1 – 26. Web. 13 Aug. 2021